免费分子动力学模拟软件：MDTOOLS替代方案

有一些类似'MDTOOLS'的免费软件，可以用于分子动力学模拟和分析。以下是其中一些常用的软件：

1. GROMACS：一个功能强大的分子动力学模拟软件，提供了广泛的功能和灵活性。
2. NAMD：一个高性能的分子动力学软件，适用于大规模系统的模拟。
3. LAMMPS：一个经典分子动力学软件，适用于各种类型的模拟。
4. OpenMM：一个用于分子动力学模拟的开源库，可以与其他软件集成使用。
5. CHARMM：一个广泛使用的分子动力学软件，提供了许多功能和分析工具。

这些软件都提供了详细的文档和使用指南，可以在它们的官方网站上找到更多信息和下载链接。