这段代码是用于绘制一个CnetPlot图,并将其保存为PDF文件。具体解释如下:

  • 'p1 <- cnetplot(edox, foldChange=foldchanges,showCategory = 10)': 这行代码创建了一个CnetPlot对象,其中'edox'是输入的数据,'foldChange'是每个节点的折叠变化值,'showCategory'表示显示的节点类别数量。
  • 'pdf('cnetplot kegg GBM.pdf',height = 15,width = 15,onefile = T)': 这行代码创建了一个名为'cnetplot kegg GBM.pdf'的PDF文件,设置了PDF文件的高度和宽度。
  • 'p1': 这行代码将CnetPlot对象绘制到PDF文件中。
  • 'dev.off()': 这行代码关闭了PDF设备,完成了文件的保存。

总结起来,这段代码的作用是绘制一个CnetPlot图并将其保存为PDF文件。


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