HKU2 病毒 M 基因分析：密码子数与相对频率

已知 HKU2 病毒 M 基因的完整序列如下：ATGAGTTCTAATTCTACTGAGTCGGTCCCTGTGACCGAAGTTTTAGAACATCTTAGGAACTGGAACTTCAGTTGGAATATTATACTGACAGTATTCATTGCAGTGCTTCAATATGGTAATATGAAGTACAGTTTCTTCCTCTATGGAGTTAAGATGTTGATCATGTGGCTTTTATGGCCCTTAGTCATTGCTTTGAGCATTTTTAATGCCTATGCTGACTTTGGTGTCAATTGGTGGTTCTTCTCCTTCAGCATTCTGATGCTTGTCATAACGCTAGTTCTCTGGCTTATGTACATAATTAATAGTTTTAAGCTTTATCGCAGAACGCGAACGTTTTGGGCATTTAACCCCGAAACAGACGCCATTGCTGTCATTTCAGTCTTTGGTAGGTCCTACTCGATACCTATGCCAGTGGCACCAACAGGTATTACTCTGACGATCTTAAGTGGAACACTCTTTTTCGATGGCATCAGAATTGCTACTGGTGTGCAGCCTGCACACTTACCGCAATTTGTGACTGTCGCCAAACCTGGCACGACTATAATTTATACTCGTGCGGGGCGTTCCCTTAATGCAAGCACCAACACTGGTTGGGCTTTTTATGTCAGAAGTAAGCATGGTGACTATTCTGCTTTATCAAATAGTAGTGATAACTGACAGAAAATGACAGATTGCTGCATTTAGTCTAA1）求出该基因中的有效密码子数2）求密码子'AGT' 使用的相对频率（编码相同氨基酸的密码子还有'AGC'、'TCG'、'TCA'、'TCC'、'TCT'）

1）有效密码子数为：107 个。

2）'AGT' 密码子在编码丝氨酸时的相对频率为：0.256（共有 5 个编码丝氨酸的密码子，'AGT'、'AGC'、'TCG'、'TCA'、'TCC'，其中 'AGT' 出现的次数为 11 次，共出现 43 次，因此相对频率为 11/43≈0.256）。