修改下面这句话 我们对收集的4组样本进行WGBS数据分析。原始数据经过QC之后每例样本都获得超过350 M左右的reads对WGBS测序比对信息见表3-2。将4组样本中检测到的CpG位点进行合并在4组样本均检测到的CpG位点一共有25542052个图3-26 A。我们使用DSS R包对HCC组织和正常肝组织进行差异甲基化分析首先鉴定出差异甲基化位点DML并将连续3个距离小于50bp的DML合并

我们对收集的四组样本进行了WGBS数据分析。原始数据经过质控（QC）后，每个样本获得了超过350 M左右的reads对。WGBS测序比对的详细信息请参见表3-2。在四组样本中检测到的CpG位点进行了合并，共计有25542052个CpG位点在所有四组样本中都被检测到（图3-26 A）。我们使用DSS R包对HCC组织和正常肝组织进行了差异甲基化分析，首先鉴定出了差异甲基化位点（DML），并将连续三个距离小于50bp的DML合并为一个差异甲基化区域（DMR），共获得了26574个DMR。DMRs的染色体分布可见图3-27 B。进一步对DMRs进行了基因元件的注释，将基因组划分为启动子（Promoter）、3'UTR、内含子（intron）、外显子（exon）、下游（downstream）以及远离基因的间隔区（distal intergenic）。启动子区域定义为转录起始位点（transcriptional start site，TSS）上下游2kb的范围。结果显示，在所有的DMRs中，有9.6%（2552/26574）位于基因启动子区域（图3-27 C）。