Rosetta .param 文件中 parent 和 child 原子的作用

在 Rosetta 的 .param 文件中，'parent' 和 'child' 原子指的是蛋白质中两个氨基酸残基之间的键连接。'parent' 原子是连接在前一个氨基酸残基上的原子，而 'child' 原子是连接在后一个氨基酸残基上的原子。这些原子的命名方式通常是通过将氨基酸的三字母缩写和原子类型组合而成的。例如，对于氨基酸残基 GLU 的 C-α 原子，'parent' 原子的命名方式为 GLU-CA 和 C，而 'child' 原子的命名方式为 GLU-CB 和 C。在 Rosetta 的 .param 文件中，这些原子的信息通常用于定义蛋白质的构象和能量函数。