ROSETTA .param 文件：parent 和原子详解

在 ROSETTA 的 .param 文件中，'parent' 指的是在构建蛋白质模型时使用的参考蛋白质结构，通常是一个已知的蛋白质结构。'原子' 指的是构成蛋白质的基本单位，包括氨基酸和其它化学原子。在 .param 文件中，原子的信息通常是用 ATOM_TYPE 和 ATOM_NAME 来描述的。ATOM_TYPE 指的是原子的类型，例如碳、氧、氮等，而 ATOM_NAME 指的是原子的名称，例如 C、O、N 等。这些信息对于构建蛋白质模型和进行蛋白质分子动力学模拟等计算任务非常重要。