韩国猫泛白细胞减少症病毒的系统发育分析

本研究对韩国16株猫泛白细胞减少症病毒(FPLV)菌株与48株非韩国菌株和2株疫苗菌株进行了比较,以进行目前在韩国猫群中流行的FPLV的系统发育分析。

研究发现,大多数区分FPLV和犬细小病毒(CPV-2, -2a, -2b和-2c)的残基(包括80-Lys, 93-Lys, 103-Val, 323-Asp, 564-Asn和568-Ala)在韩国FPLV中是保守的。 然而,在两株菌株中观察到例外情况,即K50/08(80-Gln)和V142(323-Asn)。

使用贝叶斯推断和邻接法进行的系统发育分析显示,FPLV在时间或地理上并没有明显分离。 通过分析VP2核苷酸序列,形成了三个聚类(G1,G2和G3),韩国菌株属于Cl(n = 13)和G2(n = 3)聚类。

非同义突变与同义突变的比率(dN/dS)显示净化选择作用于韩国FPLV的VP2基因。

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韩国猫泛白细胞减少症病毒的系统发育分析

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