GROMACS mdrun 错误：无效输入值和缺失选项 'topol'

这个报错是由于在运行 GROMACS 的 mdrun 命令时，输入的选项不正确或缺失导致的。

根据报错信息，错误发生在选项 's' 上，这可能是指输入了一个需要提供文件路径的选项。报错信息还指出，所需的选项未提供，并且默认文件 'topol' 不存在或无法访问。

解决此问题的步骤如下：

1. 检查命令中是否正确输入了选项 's' 及其参数。确保提供了正确的文件路径。
2. 确保所需的文件存在并且可访问。您可以使用 ls 命令检查文件是否存在，并使用 chmod 命令更改文件权限以确保可访问性。
3. 如果默认文件 'topol' 确实不存在或无法访问，您可以尝试手动指定正确的文件路径作为选项 's' 的参数。

如果您仍然遇到问题，建议查阅 GROMACS 官方网站上的文档和错误排除指南，以获取更多信息和解决方案。