荧光甲基化检测 (LUMA)：限制性酶切与测序技术结合的经典方法

另一种将限制性酶切与测序技术结合的经典方法是荧光甲基化检测 (LUMA)，该方法采用焦磷酸测序技术[80]。该方法首先使用 CpG 甲基化敏感的酶 HpaII 和甲基化不敏感的酶 MspI 对两份 DNA 进行平行消化。HpaII 和 MspI 酶的酶序列均为 CCGG，可以产生 5'-CG 的末端裸露。此外，以 EcoRI 酶作为内参酶，其识别产生的是 5'-AATT 末端的裸露。将酶切产物纯化回收后，即可进行焦磷酸测序。