MRE-seq: 基于酶切和测序的DNA甲基化检测方法

MRE-seq 是一种结合甲基化敏感性酶消化和测序技术的方法，它筛选大小在 40~220bp 之间的片段进行测序，可用于检测全基因组 DNA 的甲基化水平[77]。MRE-seq 利用 Bowtie2 或 BWA 进行比对，并利用 R 包 msgbsR 提取限制性内切酶识别的切割位点，通过比较片段的覆盖丰度来估算 DNA 的相对甲基化水平[78]。另外，之前提到的 HELP 技术[79] 也可以与测序技术进一步结合使用。