启动子区多转录本亚型分析：AP活性与转录异构体表达的相关性

研究发现，启动子区同样可能转录产生多个转录本亚型。 我们进一步对AP和相应转录本亚型之间的关系进行分析。结果如图3-12所示，在855个APs中约60.5%（517/855）为单转录本型，该启动子仅调控一条转录亚型的表达；39.5%（388/855）的APs调控至少2个转录本。单转录本型启动子的活性变化与对应转录异构体的表达变化呈显著正相关（R = 0.65，p-value < 2.2e-16，图3-12 B）。

这些选择性启动子在不同转录本亚型中表达水平有所不同。 例如，RASSF1A转录本亚型的表达与上调APs的活性显著正相关（R = 0.56，p-value = 3.7e-11），而RASSF1C转录本亚型的表达与下调APs的活性显著正相关（R = 0.47，p-value = 1.4e-07）。这表明不同转录本亚型的表达受到不同的启动子调控。这些结果进一步支持了转录异构体在基因表达调控中的重要性。