使用python编写一个主成分分析算法来筛选变量并且满足以下要求:1从CUserslenovoDesktopHIVGSE6740GSE50011基因降低data1xlsx读取Excel表格第0列为因变量其余为影响因素2进行主成分分析算法3输出得到的前6个重要变量名称4进行 主成分分析算法 常见的图形可视化展示
import pandas as pd from sklearn.decomposition import PCA import matplotlib.pyplot as plt
读取Excel表格
data = pd.read_excel('C:\Users\lenovo\Desktop\HIV\GSE6740GSE50011基因降低\data1.xlsx') X = data.iloc[:, 1:].values # 影响因素 y = data.iloc[:, 0].values # 因变量
主成分分析算法
pca = PCA(n_components=6) pca.fit(X) X_pca = pca.transform(X)
输出前6个重要变量名称
important_vars = [list(data.columns)[i] for i in range(1,7)] print("前6个重要变量名称:", important_vars)
图形可视化展示
plt.figure(figsize=(10, 5)) plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y, cmap='viridis') plt.xlabel('PC1') plt.ylabel('PC2') plt.colorbar() plt.show()
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