ATOM 1 N MET A 1 51748 36273 -32335 100 1914 N ATOM 2 CA MET A 1 52807 35248 -32477 100 1914 C ATOM 3 C MET A 1 52248 34123 -3334

可以使用sed命令进行批量替换。假设文件名为example.pdb，可以使用以下命令：

sed -i 's/ A / B /g' example.pdb

其中，-i选项表示直接修改文件，而不是输出到终端。s表示替换操作，/ A /表示待替换的字符串，/ B /表示替换后的字符串，g表示全局替换，即一行中所有匹配的字符串都会被替换。注意，在字符串前后加空格可以避免替换到不该替换的地方。