如何安装完整的RepeatMasker重复库

RepeatMasker 安装完整的重复库

您已经获取了完整的重复库，但RepeatMasker仍然提示‘Congratulations! RepeatMasker is now ready to use. The program is installed with a minimal repeat library by default. This library only contains simple, low-complexity, and common artefact ( contaminate ) sequences. These are adequate for use with your own custom repeat library. If you plan to search using common species specific repeats you will need to obtain the complete RepeatMasker repeat library from GIRI ( www.giriinst.org ) and install it in /public3/home/scg7240/software-scg7240/new/1/RepeatMasker.’。这是因为您尚未安装完整的RepeatMasker重复库。

为了安装完整的RepeatMasker重复库，你需要按照以下步骤进行操作：

1. 前往GIRI（Genetic Information Research Institute）网站，该网站提供完整的RepeatMasker重复库。网址是www.giriinst.org。

2. 在GIRI网站上，寻找并下载完整的RepeatMasker重复库。通常会以一个.tar.gz或.zip文件的形式提供。

3. 将下载的RepeatMasker重复库文件解压缩。

4. 打开终端或命令提示符窗口。

5. 导航到RepeatMasker的安装目录。在你的情况下，目录路径是/public3/home/scg7240/software-scg7240/new/1/RepeatMasker。

6. 运行以下命令以安装完整的RepeatMasker重复库：

   ./configure
   

7. 当提示是否要使用完整的RepeatMasker重复库时，选择'Y'或'yes'。

8. 命令运行完毕后，RepeatMasker就会安装完整的重复库。

现在，你应该能够使用完整的RepeatMasker重复库进行搜索了。

更多文档

您可以在以下位置找到有关RepeatMasker程序的更多文档：

/public3/home/scg7240/software-scg7240/new/1/RepeatMasker/repeatmasker.help