肽段质子化位点：影响因素、常见位点和参考文献

肽段的质子化位点是指肽段中的某个氨基酸残基在特定条件下会失去质子（H+）而形成阳离子。质子化位点通常与肽段的pKa值有关，pKa值较低的残基更容易质子化。

以下是一些常见的肽段质子化位点以及相关的参考文献：

谷氨酸（Glu）和天冬氨酸（Asp）的质子化位点：
- 谷氨酸的质子化位点为pH 4.07，天冬氨酸的质子化位点为pH 3.71。
- 参考文献：Mann, M., & Jensen, O. N. (2003). Proteomic analysis of post-translational modifications. Nature biotechnology, 21(3), 255-261.
赖氨酸（Lys）和精氨酸（Arg）的质子化位点：
- 赖氨酸的质子化位点为pH 10.53，精氨酸的质子化位点为pH 12.48。
- 参考文献：Huang, J., & MacKerell Jr, A. D. (2013). CHARMM36 all-atom additive protein force field: validation based on comparison to NMR data. Journal of computational chemistry, 34(25), 2135-2145.
苏氨酸（Ser）、脯氨酸（Thr）和酪氨酸（Tyr）的质子化位点：
- 苏氨酸的质子化位点为pH 13.28，脯氨酸的质子化位点为pH 13.71，酪氨酸的质子化位点为pH 10.07。
- 参考文献：Ollis, D. L., Cheah, E., Cygler, M., Dijkstra, B., Frolow, F., Franken, S. M., ... & Remington, S. J. (1992). The alpha/beta hydrolase fold. Protein engineering, 5(3), 197-211.

请注意，以上的质子化位点是根据常见的pKa值和一般条件下的估算值，具体的质子化位点可能会受到溶液条件、温度等因素的影响。参考文献提供了更详细的相关信息和实验数据。