Rosetta中convert_to_cst_file.sh运行后产生空的input.cst文件

这可能是因为您没有正确设置Rosetta环境变量。请确保您在运行convert_to_cst_file.sh脚本之前已经正确设置了Rosetta环境变量，并且您已经正确安装了Rosetta。

如果您已经正确设置了Rosetta环境变量并且仍然遇到此问题，请检查您的输入文件是否正确，并且您是否在正确的文件夹中运行了convert_to_cst_file.sh脚本。

另外，您还可以尝试使用其他参数运行convert_to_cst_file.sh脚本，例如：

./convert_to_cst_file.sh -pdb input.pdb -out input.cst

这将指定输入文件和输出文件的文件名，并可能解决您遇到的问题。