"执行 mpirun -np 4 gmx_mpi mdrun -deffnm benchMEM -bonded gpu -nb gpu -pme gpu -ntomp 8 报错:\nFeature not implemented:\nPME tasks were required to run on GPUs with multiple ranks but the -npme\noption was not specified. A non-negative value must be specified for -npme."\n这个错误是由于在使用 GROMACS 进行分子动力学模拟时,使用了 GPU 加速但没有指定 PME 任务在多个 GPU 上运行的数量所导致的。解决方法是使用 "-npme" 选项来指定 PME 任务在多个 GPU 上的数量。\n\n根据你的命令行参数,你需要在 mpirun 命令中加入 "-npme" 选项来指定 PME 任务在多个 GPU 上的数量。例如:\n\nmpirun -np 4 gmx_mpi mdrun -deffnm benchMEM -bonded gpu -nb gpu -pme gpu -ntomp 8 -npme 4\n\n这个例子中,"-npme 4" 指定了 PME 任务在 4 个 GPU 上运行。\n\n请根据你的实际 GPU 数量来调整 "-npme" 选项的值。

GROMACS MDrun 报错:PME 任务需要在多个 GPU 上运行

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