合并具有多个邻近TSS的区域：提升启动子分析效率和准确性

将具有多个相同或邻近的转录起始位点（TSS）的区域合并为单个启动子有以下几个原因：

减少重复计算：将具有相同或邻近TSS的区域合并为单个启动子可以避免重复计算和分析，提高计算效率。
提高准确性：合并区域可以消除噪声和误差，提高数据的准确性。具有相同或邻近TSS的区域往往代表相似的转录起始事件，将它们合并可以减少随机噪声的影响。
简化结果解读：合并区域可以简化结果的解读和呈现。将具有相同或邻近TSS的区域合并为单个启动子可以减少结果的复杂性，使研究人员更容易理解和解释结果。
提高生物学意义：合并具有相同或邻近TSS的区域可以揭示转录调控的模式和机制。这些合并启动子可能与共同的调控因子、转录因子结合位点或功能相关，从而提供对基因调控网络的更深入理解。

综上所述，将具有多个相同或邻近TSS的区域合并为单个启动子可以提高计算效率、数据准确性，简化结果解读，并揭示转录调控的模式和机制。