HepG2细胞和肝组织中mrAPs的交集分析及其启动子活性与染色质可及性关系
3.7.2 根据HepG2细胞和肝组织样本的筛选结果,我们发现在这两者中都存在17个共同的mrAPs(见图3-35A和表3-2)。我们比较了这些mrAPs在HepG2细胞内的启动子活性、甲基化水平、ATAC和DNase信号,结果表明高启动子活性通常伴随着更高的ATAC和DNase信号,暗示染色质的开放性更高(见图3-35B)。特别是ARAP1基因的prmtr.61499和prmtr.61501,其染色质可及性、甲基化状态和启动子活性之间存在显著差异。
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