HepG2细胞启动子活性与甲基化水平负相关性研究

根据HepG2细胞中启动子活性的四分位数，我们将启动子分为四组，并计算了每组TSS ± 2Kbps区域内的DNA甲基化水平的分布。我们观察到随着启动子活性增加，对应启动子的甲基化水平逐渐降低（图 3-34 A）。进一步进行相关性分析发现，选择性启动子活性变化与差异甲基化水平呈负相关（R = -0.36，p-value = 1.5×10-11）（图 3-34 B），而mrAP启动子活性变化与差异甲基化水平相关性更强（R = -0.8， p-value < 2.2×10-16）（图3-34C）。