ARAP1基因启动子甲基化与肝癌预后相关性研究

类似地，ARAP1基因的启动子活性变化与相应的预后结局相似。在TSS附近，ARAP1的两个mrAPs（prmtr.61499和prmtr.61501）的甲基化水平如图3-24 A所示。Prmtr.61499和prmtr.61501启动子活性分别与相应的ex-CpG位点的甲基化水平呈显著的负相关（R = -0.48，p-value = 0.0024 & R = -0.4，p-value = 0.013；图3-24 B）。通过使用TCGA中检测到的CpG水平将HCC患者分为高甲基化组和低甲基化组，并进行生存分析，结果显示图3-24中甲基化位点cg07031551和cg16695389是具有最高临床预后价值的启动子位点。结果表明，prmtr.61499启动子区的甲基化水平增加和prmtr.61501启动子区的甲基化水平降低可以同时预测患者更差的预后（图3-24 C）。