R语言批量Welch's t-test差异基因分析：7个样本分两组进行比较

在R语言中进行Welch's t-test差异基因分析可以使用t.test()函数。以下是一种可能的操作方式：

1. 读取输入文件，可以使用read.table()函数：

data <- read.table("input_file.txt", header = TRUE)

2. 对每个基因进行差异分析，可以使用apply()函数来遍历每一行，然后在每个基因上应用t.test()函数：

results <- apply(data[, 2:8], 1, function(row) {
  group1 <- row[1:4]  # 第一组样本
  group2 <- row[5:8]  # 第二组样本
  t.test(group1, group2)
})

3. 提取差异基因，可以根据t.test()返回的p-value或其他统计指标来筛选差异基因。例如，假设我们想筛选出p-value小于0.05的差异基因：

significant_genes <- data[results$p.value < 0.05, 1]

4. 将差异基因输出到文件，可以使用write.table()函数：

write.table(significant_genes, "output_file.txt", row.names = FALSE, col.names = FALSE, quote = FALSE)

以上是一种基本的操作方式，具体根据你的数据格式和需求可能会有所不同。