COMSOL Linux 多机并行计算教程：使用 Slurm 脚本

本教程介绍如何在 Linux 环境下使用 Slurm 作业调度器，并行运行 COMSOL 模型。我们将提供详细的脚本示例和步骤，帮助您快速上手。

1. 准备工作

确保所有计算节点已经配置好 COMSOL 软件，并且可以通过 SSH 互相访问。

2. 创建 Slurm 脚本

在主节点上编辑一个 Slurm 脚本，用于提交 COMSOL 并行计算任务。以下是一个示例脚本：

#!/bin/bash
#SBATCH -J comsol
#SBATCH -N 2
#SBATCH --ntasks-per-node=8
#SBATCH -p compute
#SBATCH -o comsol.out
#SBATCH -e comsol.err

# Load COMSOL module
module load comsol/5.6

# Set COMSOL temporary directory
export COMSOL_TMPDIR=/scratch/$USER/comsol_tmp

# Run COMSOL parallel job
mpirun -np $SLURM_NTASKS comsol batch -inputfile mymodel.mph

脚本解析：

#SBATCH 开头的行是 Slurm 调度器的参数设置，可以根据需要进行调整。
module load comsol/5.6 是加载 COMSOL 软件模块的命令，需要根据实际情况进行修改。
$COMSOL_TMPDIR 是 COMSOL 过程中的临时文件夹，需要设置在共享文件系统上，这里设置在 /scratch 目录下的用户私有文件夹中。
mpirun -np $SLURM_NTASKS 是启动并行计算任务的命令，其中 $SLURM_NTASKS 表示计算节点总数，即 COMSOL 并行计算的进程数。

3. 提交 Slurm 脚本

使用以下命令将 Slurm 脚本提交到 Slurm 调度器中：

sbatch comsol.slurm

4. 查看任务执行情况

可以使用以下命令查看当前用户的任务队列情况，包括任务 ID、状态、节点数、进程数等信息：

squeue -u $USER

5. 查看结果

任务完成后，可以在 comsol.out 和 comsol.err 文件中查看任务的标准输出和标准错误信息。如果 COMSOL 模型设置了输出文件，也可以在指定的文件夹中查看计算结果。