DBSCAN 聚类分析: 使用 R 语言对 I0 PA500 HFS DA 数据进行聚类
以下是使用 R 语言实现 DBSCAN 聚类的代码:
# 读入数据
data <- read.table('data.txt', header = TRUE)
# 定义距离函数(欧几里得距离)
dist_func <- function(x, y){
sqrt(sum((x - y)^2))
}
# 定义 DBSCAN 函数
DBSCAN <- function(data, eps, minPts){
# 初始化标签和核心对象集合
labels <- rep(0, nrow(data))
core_objs <- numeric()
# 计算距离矩阵
dist_mat <- dist(data, method = dist_func)
# 遍历每个数据点
for (i in 1:nrow(data)){
# 找出半径为 eps 内的数据点
neighbor_inds <- which(dist_mat[i, ] <= eps)
# 如果邻居数小于 minPts,则标记为噪声点
if (length(neighbor_inds) < minPts) {
labels[i] <- -1
} else {
# 否则将该点标记为核心对象
core_objs <- c(core_objs, i)
# 初始化簇号
cluster <- length(core_objs)
# 以该点为起点,通过广度优先搜索找出所有密度可达的点
while (length(neighbor_inds) > 0){
# 取出一个邻居
curr <- neighbor_inds[1]
neighbor_inds <- neighbor_inds[-1]
# 如果该邻居还没有被访问过,则标记为已访问
if (labels[curr] == 0){
labels[curr] <- cluster
# 如果该邻居也是核心对象,扩展其邻居
if (curr %in% core_objs){
neighbor_inds <- c(neighbor_inds, which(dist_mat[curr, ] <= eps))
}
}
}
}
}
# 返回聚类结果
return(list(labels = labels, core_objs = core_objs))
}
# 调用 DBSCAN 函数进行聚类
result <- DBSCAN(data, eps = 50, minPts = 3)
# 输出聚类结果
print(result$labels)
注意:上述代码中的数据读入和距离函数需要根据实际情况进行修改。另外,DBSCAN 参数的选择需要根据数据集进行调整。
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