桔梗治疗脓毒症的PPI网络分析及关键靶点识别

为了构建PPI网络，我们将56个交集基因上传至STRING数据库，并指定物种为人类，相互作用评分设定为0.9。我们去除了游离靶蛋白，得到了图2。随后，我们将该网络保存为TSV文件，并导入Cytoscape 3.9.1软件进行可视化网络图的构建，如图3所示。该网络共有47个节点和304条边，展现了桔梗通过多组分、多靶点协同作用于脓毒症的方式。边代表靶蛋白之间的相互作用关系，连接的边数越多，则节点靶蛋白在此网络中与其他靶蛋白的相互作用越多，且越关键。通过拓扑学分析，我们发现交集靶点的度值中位数为12，共有26个靶点的度值大于中位数，例如TP53、AKT1、RELA、CASP3、IL6、MAPK1、BCL2L1、CASP8、TNF、IL10、IL2、MCL1、IL4等。这表明这些靶点在桔梗治疗脓毒症的过程中作用程度较高，可能是治疗脓毒症的核心靶点。