Canu 软件运行参数设置指南：提高基因组组装效率

Canu 软件是一款用于长读长序列组装的软件，其运行时的参数设置可以通过命令行或配置文件进行设置。以下是一些常用的参数及其含义：

genomeSize：指定待组装的基因组大小，可以是一个大致的估计值或者一个明确的值，如'genomeSize=3g' 或 'genomeSize=3000000'。
corOutCoverage：指定纠错步骤中输出序列的覆盖度，默认值为 50。
minReadLength：指定过滤掉的最小读长，默认值为 2000。
corMhapSensitivity：指定 mhap 纠错步骤的敏感度，默认值为 'normal'。
maxMemory：指定 Canu 使用的最大内存，单位为 GB，默认值为 32。
gridOptions：指定在集群上运行 Canu 时的参数，如 'gridOptions="-N myJob -q long.q"'。
ovlMerThreshold：指定短序列的最小重叠长度，默认值为 500。
batOptions：指定在运行 overlap 步骤时使用的参数，如 'batOptions="-eg 0.0001 -dc 1 -s 25"'。
corOvlMemory：指定在纠错步骤中用于 overlap 的最大内存，单位为 GB，默认值为 16。
corThreads：指定用于纠错的线程数，默认值为 8。

以上是 Canu 运行时的一些常用参数设置，具体使用时可以根据实际情况进行调整。