QIIME2 中 DADA2 的质量控制：代码、选项和最佳实践

在 QIIME2 中，DADA2 的质量控制代码是 'qiime dada2 denoise-single' 或 'qiime dada2 denoise-paired'，具体取决于你的测序数据是单端还是双端。在这些命令中，可以调整参数来控制质量控制的强度或关闭质量控制。例如，通过指定不同的截断参数或禁用质量过滤参数可以调整质量控制的强度。但是，关闭质量控制可能会导致低质量序列的引入，从而影响下游分析的结果。因此，建议在进行质量控制时保持适度的强度。