QIIME2 中的 GREENGENE 和 SILVA 数据库:序列长度和全长序列
在 QIIME2 的 GREENGENE 和 SILVA 数据库中的序列通常是全长序列,但在一些情况下可能会存在缺失或截断的序列。
'古菌 > 900bp,细菌 > 1200bp' 指的是在这两个数据库中,古菌的序列长度大于等于 900 个碱基,细菌的序列长度大于等于 1200 个碱基。这是因为不同的生物群体在其 16S rRNA 基因中的变异程度不同,因此需要对序列长度进行限制,以确保序列的可比性和分类准确性。
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