R语言包ggpubr 组间比较，添加pvalue

您可以使用stat_compare_means函数来添加p值。

首先，您需要安装和加载ggpubr包。

install.packages("ggpubr")
library(ggpubr)

然后，您需要创建一个包含组别和值的数据框。

df <- data.frame(
  group = rep(c("A", "B", "C"), each = 10),
  value = c(rnorm(10, 10, 2), rnorm(10, 12, 2), rnorm(10, 8, 2))
)

接下来，您可以使用ggboxplot函数来创建箱线图。使用stat_compare_means函数来添加p值。

ggboxplot(df, x = "group", y = "value", 
          color = "group", palette = "jco") +
  stat_compare_means(method = "t.test")

这将生成一个箱线图，其中每个组之间的差异都有一个p值。

请注意，p值的计算方法可以通过设置method参数来更改。在上面的示例中，我们使用了t.test方法来计算p值。