这段代码主要做了以下两件事情:

  1. 将数据框'Phylum'中的行名称(即分类群名称)转化为因子变量,并按照逆序排序。
Phylum$Phylum <- factor(rownames(Phylum), levels = rev(rownames(Phylum)))
  • rownames(Phylum)获取'Phylum'数据框的行名称。
  • factor()将行名称转化为因子变量。levels = rev(rownames(Phylum))指定因子变量的级别按照行名称的逆序排序。
  • Phylum$Phylum将因子变量赋值给'Phylum'数据框中的'Phylum'列。
  1. 将数据框'Phylum'按照分类群名称(即'Phylum'列)进行长格式转换。
Phylum.t <- melt(Phylum, id.vars = 'Phylum')
  • melt()函数实现数据框的长格式转换。Phylum表示待转换的数据框,id.vars = 'Phylum'表示'Phylum'列不需要进行转换。
  • 转换后的数据框'Phylum.t'包含三列:'Phylum'(分类群名称)、'variable'(变量名称)、'value'(变量值)。其中,变量名称和变量值来自于原数据框'Phylum'中的列名和数值,转换后被整合到了'variable'和'value'列中。

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