利用化学计量平衡、热力学可行性和动力学定律形式进行约束和机器学习基础代谢建模的最新进展

利用化学计量平衡、热力学可行性和动力学定律形式进行约束和机器学习基础代谢建模的最新进展

深入理解生物体代谢和生长的控制原理是生物生产载体的有效应用的基础。代谢建模的核心目标是预测代谢和生长如何受到外部环境因素和内部基因型扰动的影响。反应化学计量、热力学和质量作用动力学的基本概念已经成为许多建模框架的基础原理，用于描述生物体资源分配生长和生物生产的原因和方式。本综述关注的是最新的算法进展，将这些基础原理融入日益复杂的定量框架中。

关键词: 代谢建模，化学计量平衡，热力学可行性，动力学定律，机器学习，算法，代谢工程，生物生产，基因型扰动

引用: 《代谢工程学杂志》（2021）63：13-33。