D-泛解酸内酯水解酶的催化机理和活性中心研究

D-泛解酸内酯水解酶的活性中心包含一个酪氨酸、一个天冬氨酸、一个谷氨酸、两个天冬酰胺、一个钙离子、一个组氨酸以及一个催化水分子。钙离子与两个天冬酰胺以及一个谷氨酸和天冬氨酸配位，同时还与D-泛解酸内酯的酯基氧配位。天冬氨酸提取水分子的质子进行质子化，然后水作为亲核试剂进攻羰基碳。

酪氨酸和组氨酸在活性中心中可能起着促进底物与酶的结合、稳定中间体以及参与催化反应等作用。

关于两种酶结合方式，第一种情况是酶口袋的组氨酸与D-泛解酸内酯的羟基形成氢键，酪氨酸与D-泛解酸内酯的酯氧基形成氢键。第二种情况是酪氨酸去质子化与D-泛解酸内酯的羟基形成氢键，组氨酸与D-泛解酸内酯的酯氧基形成氢键。目前，哪一种情况更合理还需要进一步的实验验证和计算模拟才能确定。