D-泛解酸内酯水解酶活性中心结构及催化机理分析
推测的催化机理较为合理。天冬氨酸通过提取水分子的质子进行质子化,使水分子成为亲核试剂,攻击羰基碳,从而使D-泛解酸内酯水解成D-泛醇和解酸,同时释放出一个羟基离子,羟基离子与钙离子形成氢键,使得活性中心得以恢复。
活性中心中的酪氨酸和组氨酸的作用分别是定向D-泛解酸内酯分子的位置和提供氢键相互作用。在第一种情况中,酪氨酸和D-泛解酸内酯的酯氧基形成氢键,组氨酸和D-泛解酸内酯的羟基形成氢键,这种情况下酪氨酸和组氨酸提供了定向D-泛解酸内酯分子位置和氢键相互作用的作用,因此是合理的。
在第二种情况中,酪氨酸去质子化与D-泛解酸内酯的羟基形成氢键,组氨酸氨基与D-泛解酸内酯的酯氧基形成氢键。这种情况下,组氨酸提供了氢键相互作用,但酪氨酸并未提供定向D-泛解酸内酯分子位置的作用。因此,第一种情况更合理。
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