D-泛解酸内酯水解酶的催化机制:活性中心结构与反应步骤
D-泛解酸内酯水解酶的催化机制如下:
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在初始状态下,酶的活性中心中钙离子与两个天冬酰胺、一个谷氨酸和一个天冬氨酸配位,而催化水分子处于其附近。
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底物D-泛解酸内酯结合到酶的活性中心,并与活性中心中的酪氨酸形成氢键。
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钙离子与一个天冬酰胺、一个谷氨酸和一个天冬氨酸一起协同作用,使得相邻的两个天冬酰胺酰胺键发生断裂。
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断裂的天冬酰胺酰胺键中间形成了一个酰氧离子中间体,同时活性中心中的催化水分子进入到中间体中。
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催化水分子被活性中心中的组氨酸质子化,从而形成质子化水分子,该质子化水分子与酰氧离子中间体发生核攻击反应,从而形成羟基(-OH)和D-泛解酸。
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最终产物D-泛解酸离开酶的活性中心,酶恢复到初始状态。
 
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