PhiSpy: 基于机器学习的溶源噬菌体预测工具
PhiSpy 基于基因组序列的特征和整体结构,使用机器学习算法来预测溶源噬菌体。具体来说,PhiSpy 分析基因组中的开放阅读框架 (ORFs),并对它们的位置、长度、氨基酸序列、同义密码子使用频率、GC 含量等特征进行评估。同时,PhiSpy 还分析基因组中的非编码序列、反向重复序列和整体基因组结构等因素,以提高预测准确率。最终,PhiSpy 根据这些特征和机器学习算法,预测哪些 ORFs 可能属于溶源噬菌体,并生成相应的报告。
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