PhiSpy 如何识别溶源噬菌体？

PhiSpy 识别溶源噬菌体的依据是基于以下几个特征：

1. 基因组结构：PhiSpy 检测到的噬菌体基因组通常包含有序模块（ordered modules），这些模块在噬菌体发育过程中起到重要作用。

2. 基因组大小：溶源噬菌体基因组通常比非溶源噬菌体基因组小。

3. 基因组组成：溶源噬菌体基因组中通常包含多个编码溶解素的基因。

4. 基因组编码策略：溶源噬菌体基因组中的基因通常采用一种非常紧凑的编码策略，这种策略可以最大程度地减少基因组大小，从而提高基因的表达效率。

5. 大量基因的存在：溶源噬菌体基因组中通常包含大量基因，这些基因与非溶源噬菌体基因组相比更加多样化，包括编码各种酶和调节蛋白的基因等。

通过这些特征的分析和比较，PhiSpy 可以准确地判断一个噬菌体是否为溶源噬菌体。