CentOS系统命令行源码安装GPU版Schrodinger教程

本教程将指导您如何在CentOS系统下使用命令行方式源码安装GPU版本的Schrodinger软件。

1. 安装CUDA和cuDNN

首先需要安装CUDA和cuDNN。建议安装CUDA 10.0及以上版本，cuDNN 7.3及以上版本。具体安装步骤请参考官方文档。

2. 下载Schrodinger

从Schrodinger官网下载源码包，例如'schrodinger_suite-2018-2_linux-x86_64.tar.gz'。

3. 解压源码包

使用以下命令解压源码包：

tar -zxvf schrodinger_suite-2018-2_linux-x86_64.tar.gz

4. 安装依赖库

进入解压后的文件夹，执行以下命令安装依赖库：

cd schrodinger_suite-2018-2
./internal/bin/syscheck -check

根据提示安装缺失的依赖库。

5. 配置环境变量

执行以下命令配置环境变量：

export SCHRODINGER=$PWD
export PATH=$SCHRODINGER/internal/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$SCHRODINGER/internal/lib:$LD_LIBRARY_PATH

6. 编译安装GPU版本Schrodinger

执行以下命令编译安装GPU版本Schrodinger：

./run -install_gpu

等待编译完成即可。

7. 测试

执行以下命令测试Schrodinger是否安装成功：

maestro -test

如果输出类似以下内容，则表示安装成功：

Maestro test completed successfully.