Blast本地建库参数 -parse_seqids 解释及应用
Blast本地建库时,可以使用'-parse_seqids'参数来指定是否在库中保留序列的GI号或Accession号等标识符。如果指定了该参数,blast会将这些标识符解析为序列的名称,并将它们保存在库中。这样,在进行blast搜索时,可以使用这些标识符来精确地匹配查询序列和库中的序列。
如果没有指定该参数,则blast会将所有序列的名称都设置为数字,并且不会将标识符保存在库中。这样,在进行blast搜索时,就只能通过序列的名称来匹配查询序列和库中的序列,可能会导致匹配不准确或者遗漏一些序列。因此,建议在建库时使用'-parse_seqids'参数来保留序列的标识符,以提高搜索的准确性和可靠性。
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