vsearch 的 --sintax_cutoff 参数指定 OTU 和参考序列对之间的最小相似度,通常设置为 0.8 到 0.9。这取决于您的研究目的和数据集的特征。如果您希望更严格地过滤序列,可以选择更高的阈值,例如 0.9 或更高。如果您希望允许更多的变异,可以选择较低的阈值,例如 0.8 或更低。

vsearch --sintax_cutoff 参数设置指南:如何选择最佳相似度阈值

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