Vsearch -sintax_cutoff 参数设置指南

对于 Vsearch 的 -sintax_cutoff 参数，其值应该根据具体的实验设计和分析目的进行设置。一般来说，较高的 -sintax_cutoff 值会导致更严格的分类，而较低的值则会导致更宽松的分类。因此，选择合适的 -sintax_cutoff 值需要平衡分类的准确性和覆盖范围。具体来说，可以通过比较不同 -sintax_cutoff 值的结果，评估分类的准确性和分类的物种覆盖率，最终选择一个合适的值。一般建议先从默认值 0.8 开始尝试，根据实际情况进行调整。