Rosetta Ligand Docking 错误: Pose 没有 Jumps 的解决方法
是的,您可以尝试使用Rosetta中的Jump定义工具来定义连接点。您可以使用以下命令来定义连接点:
JumpDefinition <pose> <chain1> <res1> <atom1> <chain2> <res2> <atom2>
其中,<pose>是您的蛋白质构象文件,<chain1>和<chain2>是连接点所在的两个链的标识符,<res1>和<res2>是连接点所在的两个氨基酸残基的标识符,<atom1>和<atom2>是连接点所在的两个原子的标识符。
例如,如果您的连接点是位于链A的第10个氨基酸残基和链B的第20个氨基酸残基之间的Cα原子,则可以使用以下命令来定义连接点:
JumpDefinition my_pose A 10 CA B 20 CA
定义完连接点后,您可以将其包含在您的Rosetta运行命令中,以确保正确的连接点被使用。
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