Rosetta 蛋白质设计软件中的 <DSasa> 标签解析

这是 Rosetta 蛋白质设计软件中的一个选项，用于定义蛋白质表面的溶剂可及表面面积 (SASA)。具体来说，'' 表示在设计蛋白质时，只考虑表面上的残基，而忽略内部的残基；lower_threshold 和 upper_threshold 则是定义表面残基的相对溶剂可及性，即表面面积与全球最大表面面积的比例，其中 0.3 表示表面残基的相对溶剂可及性不能低于 30%，0.95 表示表面残基的相对溶剂可及性不能高于 95%。这些参数可以影响蛋白质设计的精度和速度。