Rosetta蛋白质设计软件中AddOrRemoveMatchCsts命令详解

Rosetta蛋白质设计软件中AddOrRemoveMatchCsts命令详解

在Rosetta蛋白质设计软件中，AddOrRemoveMatchCsts命令用于添加或删除匹配约束（match constraints）。本文将详细介绍该命令的使用方法，帮助你理解其各个参数的含义。

命令格式

<AddOrRemoveMatchCsts name=约束名称 cst_instruction=约束指令 cstfile=约束文件名/>

参数说明

• name: 约束名称，自定义，用于标识该约束。
• cst_instruction: 约束指令，可选值为'add_new'（添加新约束）或'remove_existing'（删除已有约束）。
• cstfile: 约束文件名，指定包含约束信息的文本文件路径。

示例

以下命令将在Rosetta脚本中添加一个名为'cstadd'的新匹配约束，约束信息存储在文件'DIG_yyhff.cst'中：

<AddOrRemoveMatchCsts name=cstadd cst_instruction=add_new cstfile=DIG_yyhff.cst/>

总结

AddOrRemoveMatchCsts命令是Rosetta蛋白质设计中一个重要的命令，它允许你灵活地控制蛋白质结构中的匹配约束。通过设置不同的参数，你可以轻松添加或删除约束，以满足不同的设计需求。