使用 SLURM 运行 Rosetta relax 程序的脚本

这是一个 SLURM 脚本，用于在超级计算机上运行 Rosetta 的 relax 程序。

#!/bin/bash

#SBATCH --time=05:00:00
#SBATCH --mem=4G
#SBATCH --output=relaxing.%j.out
srun mpiexec
rosetta/main/source/bin/relax.mpi.linuxgccrelease database rosetta/main/database -s path_to_clean_file/clean_file -nstruct number_of_relaxed_structures

SBATCH 是一种用于调度作业的工具，可以设置作业运行的时间、内存和输出文件名等参数。该脚本使用 srun 命令来启动 mpiexec，mpiexec 用于在多个进程之间分配任务并管理它们的通信。relax.mpi.linuxgccrelease 是 Rosetta 程序的可执行文件，用于进行蛋白质分子动力学模拟和结构优化。该脚本需要指定 'clean_file' 的路径和要生成的结构数量。