Rosetta molfile_to_params.py 脚本使用指南：将 SDF 文件转换为 Rosetta 参数文件和 PDB 文件

这段命令是在使用 Rosetta 蛋白质设计软件中的 molfile_to_params.py 脚本，将一个名为 'output_ligand_file_2.sdf' 的分子文件转换为 Rosetta 所需的参数文件和分子文件，并将结果保存为 'output_ligand_file_3.params' 和 'output_ligand_file_3.pdb' 文件。其中，'-n' 指定参数文件的名称，'-p' 指定分子文件的名称，'-conformers-in-one-file' 表示将所有构象保存在一个文件中。