Rosetta 蛋白质设计筛选脚本：使用 Design Select.pl 筛选符合评分标准的设计结果

这是一个 Rosetta 脚本，用于从蛋白质设计的输出文件中筛选出符合一定评分标准的设计结果，并将其输出到一个名为 'filtered_designs.sc' 的文件中。

具体来说，该脚本使用了 Design Select.pl 工具，通过读取输出文件中的评分信息（使用 grep 命令提取），并根据预先设定的评分阈值 ('metric_thresholds_1.txt') 进行筛选。筛选结果将按照最后一列的标签 ('tag_column last') 进行排序，并输出到 'filtered_designs.sc' 文件中。

'$WRKDIR' 表示当前工作目录，可以根据实际情况替换为其他路径。

该脚本的具体命令如下：

Design Select.pl -d <(grep SCORE output_design_file.out) -c metric_thresholds_1.txt -tag_column last > filtered_designs.sc

该命令的含义如下：

• Design Select.pl：Rosetta 中用于筛选设计结果的工具。
• -d <(grep SCORE output_design_file.out)：读取输出文件 'output_design_file.out' 中包含 'SCORE' 的行，作为筛选的输入。
• -c metric_thresholds_1.txt：指定评分阈值文件，该文件包含每个评分指标的阈值。
• -tag_column last：指定按照最后一列的标签进行排序。
• > filtered_designs.sc：将筛选结果输出到文件 'filtered_designs.sc' 中。

通过使用该脚本，可以快速筛选出符合特定评分标准的设计结果，从而提高蛋白质设计效率。