Rosetta 蛋白质设计软件脚本解析:使用 DesignSelect.pl 筛选高得分界面
这段脚本使用 Rosetta 软件中的 enzdes/Design 模块进行蛋白质设计。具体步骤如下:
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从 'interfaces.sc' 文件中筛选出得分高的界面(interface)信息,使用 grep 命令实现。
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将得分高的界面信息作为输入参数传递给 Design 模块的 Select.pl 脚本。
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在 Select.pl 脚本中,使用 'metric_thresholds_2.txt' 文件中定义的阈值来筛选出符合要求的界面信息,并将结果保存到 'filtered_interfaces.sc' 文件中。
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最后,使用 '-tag_column' 选项将最后一列作为标签添加到 'filtered_interfaces.sc' 文件中。
具体命令参数的含义如下:
-d:指定输入文件(即得分高的界面信息)。
-c:指定阈值文件。
-tag_column:指定要添加的标签列。
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