Rosetta 脚本中 extension_window='3' 参数详解

在 Rosetta 脚本中，extension_window='3' 指的是在蛋白质设计过程中，每次扩展的窗口大小为 3 个氨基酸残基。具体来说，这个参数控制着 Rosetta 在构建新的蛋白质序列时可以插入的氨基酸残基数量。较小的窗口大小可以使 Rosetta 更快地搜索可行的序列空间，但可能会导致搜索空间的缩小。较大的窗口大小可以增加搜索空间，但可能会增加计算时间和计算资源的消耗。