DBSCAN无监督分类模型实现:基于心电信号的聚类分析
使用DBSCAN进行心电信号聚类分析
本示例展示了如何使用scikit-learn库中的DBSCAN算法对869个心电信号数据进行无监督分类,并将结果存储在本地。
数据准备:
- 数据文件:abnormal_list.txt,包含869个CSV文件名,每一行为一个CSV名字,CSV文件保存在当前目录下的Abnormal目录中。
- 每个CSV文件只有一列数据,每列数据有361行,数据格式是浮点数类型,代表心电信号。
代码示例:
import os
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.cluster import DBSCAN
import matplotlib.pyplot as plt
# 读取abnormal_list.txt中的文件名
with open('abnormal_list.txt', 'r') as f:
filenames = f.read().splitlines()
# 读取csv文件并将其转换为numpy数组
data = []
for filename in filenames:
filepath = os.path.join('Abnormal', filename)
df = pd.read_csv(filepath, header=None)
data.append(df.values.flatten())
data = np.array(data)
# 使用DBSCAN进行聚类
dbscan = DBSCAN(eps=0.5, min_samples=5)
labels = dbscan.fit_predict(data)
# 将每个csv文件的类别结果保存在本地
for i, filename in enumerate(filenames):
with open(f'cluster_results/{filename}', 'w') as f:
f.write(str(labels[i]))
# 绘制聚类可视化图并保存在本地
plt.figure(figsize=(8, 8))
markers = ['o', 's', '^', 'd', 'v'] # 不同类别使用不同形状标记
for i in range(-1, 4): # -1为噪声点
plt.scatter(data[labels == i, 0], data[labels == i, 1], marker=markers[i+1], label=f'Cluster {i+1}')
plt.legend()
plt.savefig('cluster_visualization.png')
plt.show()
代码说明:
- 读取CSV文件数据并将其转换为NumPy数组。
- 使用DBSCAN算法进行聚类,并保存聚类结果到本地。
- 绘制聚类可视化图,每个类别用不同的形状标记,并保存到本地。
注意事项:
- 由于每个CSV文件只有一列数据,因此需要使用
flatten()方法将其展开为一维数组。 - DBSCAN算法需要指定
eps和min_samples两个参数,分别表示邻域半径和最小样本数。这两个参数的具体取值需要根据数据特点进行调整。
扩展阅读:
原文地址: https://www.cveoy.top/t/topic/jKsN 著作权归作者所有。请勿转载和采集!