宏基因组分箱结果什么样的才算一个完整的基因组完整度？污染率？还是tRNA？CDS？有什么标准吗？

宏基因组分箱结果是将从环境样品中获得的DNA序列分组为代表不同微生物种类的"分箱"或"组装"单位。一个完整的基因组通常指的是一个细菌、古菌或真核生物的完整基因组序列。

完整度是衡量一个基因组分箱的质量的重要指标之一。完整度指的是分箱所代表的微生物基因组与已知已完成基因组的相似性程度。通常使用CheckM等工具来评估基因组的完整度，评估基因的复制数、单拷贝基因的数量和多拷贝基因的比例等因素。

污染率是指在一个基因组分析中，与目标微生物无关的DNA含量。高污染率可能来自于环境样品中其他微生物的DNA污染、宿主DNA或实验室重组DNA的污染等。通过分析非目标微生物的比例来评估污染率。

tRNA和CDS（编码蛋白质的基因）是评估一个基因组完整性的指标之一。tRNA和CDS的存在可以表明基因组的功能性。

然而，并没有一个统一的标准来定义完整的基因组。具体的评估标准可能会因研究目的、样本来源和研究领域而有所不同。不同研究中可能会使用不同的工具和指标来评估基因组的完整性和质量。因此，在研究中需要根据具体情况选择适用的评估指标和工具。